Поскольку 5-ка новая я бы сначала убедился, что с родной 580 управление все отрабатывает. А уж потом бы сигму терзал с пристрастием. Ведь на старом аппарате она же отрабатывала (кстати - на каком?).
Более того, может действительно быть, что К в 5DM2 уже заложил "улучшенный" протокол E-TTL2, о котором (как обычно :D) не поставил никого в известность.
В любом случае, похоже, что Вы нам и расскажете, насколько эта связка получилась совместимой...