Копирую фотографии через родной софт. Он сам раскидывает все по папкам, присваивая им в качестве имени дату съемки. Мне кажется очень удобно. А вот зерна от плевел (RAW от JPG) приходится отделять вручную - тут надо бы Canon доработать ПО. Хотя в jpg снимаю мало, поэтому для меня это не такая уж большая проблема.
Правда вот, на чужие компьютеры я копирую не часто. В основном только на работе, но там я установил родное ПО.
Но если Вы пользуетесь каод-ридером - то похоже все придется делать собственными руками (или таскайте с собой ПО, как уже советовали, но придется тратить время на его инсталляцию).