Вот, тут недалеко есть инструкция:
http://www.eosdoc.com/manuals/?q=100-400LIS
Выдернул из неё цитатку:
Do not remove the lens while the IS function is active. Set the "Stabilizer" switch to 0 to ensure that IS is inactive.
Т.е. для полной уверенности лучше выключать.:gulp: