Нет, не будет.
Вот, что написано в каталоге объективов про связку Extender Canon 2x II + Canon EF 70-200/4L:
With the EOS-1Ds Mark II, EOS-1D Mark II, EOS-1Ds, EOS-1D, EOS-1V and EOS-3, AF is possible with the center focusing point.